Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms