Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFIP11Q9UBB9 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms