Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00597Q9H2U6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms