Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms