Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms