Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIN3AQ96ST3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms