Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNDC1Q96C34 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms