Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLDN23Q96B33 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN23Q96B33 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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