Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL3LQ92901 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL3LQ92901 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL3LQ92901 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL3LQ92901 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL3LQ92901 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL3LQ92901 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL3LQ92901 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms