Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SEMA6DQ8NFY4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SEMA6DQ8NFY4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SEMA6DQ8NFY4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SEMA6DQ8NFY4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SEMA6DQ8NFY4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SEMA6DQ8NFY4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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