Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms