Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLIP4Q8N3C7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLIP4Q8N3C7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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