Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC84Q86UT8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms