Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECW1Q76N89 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms