Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms