Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms