Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SCN9AQ15858 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SCN9AQ15858 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SCN9AQ15858 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN9AQ15858 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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