Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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