Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RAB35Q15286 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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