Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms