Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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