Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMS2P11Q13670 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms