Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PMS2P3Q13401 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms