Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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