Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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