Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TROQ12816 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TROQ12816 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms