Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms