Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMF1P82094 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMF1P82094 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMF1P82094 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms