Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTA1P68133 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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