Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LOXL3P58215 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1015.3 ms