Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms