Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms