Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms