Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRHP20396 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRHP20396 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRHP20396 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRHP20396 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRHP20396 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRHP20396 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRHP20396 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRHP20396 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRHP20396 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms