Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGFRP00533 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGFRP00533 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGFRP00533 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGFRP00533 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGFRP00533 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGFRP00533 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGFRP00533 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGFRP00533 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGFRP00533 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGFRP00533 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms