Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEBLO76041 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEBLO76041 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NEBLO76041 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NEBLO76041 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms