Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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