Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AP001993.1-201ENST00000527317 2337 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RAPGEF3-201ENST00000389212 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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