Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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