Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms