Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMG5Q9UPR3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMG5Q9UPR3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms