Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms