Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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