Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms