Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFDQ9GZP0 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms