Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC13A1Q9BZW2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms