Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP2-4Q9BYR9 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms