Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHOXF2Q9BQY4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms