Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms