Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4AQ8WYN0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms